从前,在印度有一个名叫奥金的小国,有位富有而慈悲的国王名叫印第菩提,他为了子民的福祉,不但将自己的财富,甚至自己的双目都慷慨地布施。当他的独子不幸去世后,他感到十分悲痛;而祸不单行,国家又遭逢连年旱灾和饥荒,其时国库空虚,人民只有吃那些未成熟的稻析花卉为生。国王除了倾囊布施外,更向神圣的佛陀祷告。
观音菩萨在极乐世界看见此种情景,便恳请阿弥陀佛救度此等众生。阿弥陀佛的舌头立时射出一道红光往丹那湖中的一莲花,莲花立时绽开,从弥陀心中再射出一直立金刚杵内有一个舍(HRI)字,立于莲花上,在彩虹光芒中化为一个八岁小童端坐于莲花上,四周绕著空行母。如是,由最具慈悲的佛心所化生之莲花生大士,便降临这世间救度众生。
印度菩提国王当时非常颓丧,于绝望的边缘他决定冒险前往深海,向海龙王祈求一颗愿望宝石,几经艰苦,他终于成功地到达龙宫,海龙王送了他很多宝石,阿述祂女神更赠他一颗夺目的「愿望宝石」。
国王小心翼翼地端著这吉祥宝石,用布包起来,放进怀里。归途中,他许了一个善愿,一剎那间,他瞎了的左眼便重见光明。当国王经过丹那湖的时候,看见一道五色彩虹高悬天际,更见一巨莲上端坐著一个散发金光的小孩,他还以为自己在造梦,便问那小孩究竟是何人,来自何处。
小孩答道:「我无父无母,是阿弥陀佛和观音菩萨的化身,我的使命是来普渡众生、弘扬金刚乘教义的。」国王听后,视力完全恢復,他很高兴地封他为「太子」及王位继承人,取名为莲花生。此后,奥金国风调雨顺,国泰民安。
莲花生长大后,印第菩提国王为他迎娶漂亮的善普那公主为妻,并封他为国王,称为贝玛嘉波(Padma Gyalpo),更把那颗愿望宝石送了给他,并对他说:「它可实现你任何愿望。」但王子拒绝说:「我所见到的都是愿望宝石。」于是他请父王张开手,随即出现另一颗「愿望宝石」。
莲花生大士拥有世间的权力和物质受用,但他了解世间的虚妄和烦恼,更欲放弃王位离众,便对父王说:「世间生命短暂,轮回不息,生离死别是不可避免的,我等应精进修行,以求解脱。」不久,莲花生大士被指控杀死一位大巨的妻子及其儿子而负罪,被判流放他乡,从而得离开皇宫,开始过著瑜珈士的生活。
莲花生大士在印度八个著名墓地专心一意的修行,其中在菩提伽耶附近的檀香木坟场,大士以尸体为座,进入甚深三摩地。修行五年当中,空行母常来为他灌顶及说法,大士以祭品为食,裹尸布为衣,在每处墓地他都跟随忿怒本尊和大成就者修法,同时,更超越空间到各处寻求深奥的教义。经过不断精进修持,他终於克服了所有逆境,而得诸成就,取名为忿怒金刚。
在彭马华苑的地方,大士学会了无数治病的方法,在瓦高拿的地方,大士遇到了一位白髮长者,并随他学习语言和文字。大士跟他学会了梵文、天文的圣语,析其他三百六十种语言和六十四种文字。后来他又学会雕刻艺术和各种工艺,又为艺术界的精工者。
大士跟随阿难尊者,学习文载的经典和註解,随估耶佛陀学习【大瑜珈密续】,跟司里禪哈学习【无上金刚密续】,随伽蜡多芝大圆满者学最高密法,别的〔菩萨们〕教导他占星学、哲学、逻辑学、物理和其他世间知识。
还有位空行母化身为文武百尊,传他《马头明王坛城灌顶》,使他有力量降服一切外魔与心魔的障碍。莲花生大士学了《三藏》的外、内和《密续》教义,他成为一位世间所有存在学间的大师。